La sertralina è un moderato inibitore dell'isoenzima 2D6 e un debole inibitore degli isoenzimi 2C9/10 e 2C19 del citocromo P450.
La clozapina è è metabolizzata in prevalenza dal CYP2D6, ma anche dal CYP1A2 e dal CYP2C19.
L'associazione della sertralina con la clozapina non dovrebbe determinare un eccessivo innalzamento dei tassi plasmatici di quest'ultima.